動物用藥之檢測項目：
氯黴素類抗生素、硝基喃類代謝物(共4種)、孔雀綠及其代謝物、四環黴素類抗生素、食品中動物用藥殘留量檢驗方法-多重殘留分析(二)(48品項)。

重金屬之檢測項目：
重金屬元素、重金屬掃描、無機砷及甲基汞。

環境衛生菌之檢測項目：
大腸桿菌、大腸桿菌群、總生菌數、霍亂弧菌。

一般成分分析之檢測項目：
水分、灰分、粗蛋白、粗脂肪、粗纖維、脂肪酸組成(含飽和脂肪酸和不飽和脂肪酸)、八大營養標示。

疾病分析項目:
水體微生物檢驗、未知細菌鑑定、水產細菌藥物敏感性試驗、細菌病原檢測(發光桿菌 (兩種亞種皆可)、溶藻弧菌、無乳鏈球菌、異乳鏈球菌、海豚鏈球菌、創傷弧菌、親水性產氣單胞菌、哈威弧菌、蝦早死病 (腸炎弧菌-毒素A&B)、寄生蟲檢測(蝦肝胰腺微孢子蟲症EHP)、病毒病原檢測(蝦傳染性皮下及造血組織壞死病毒 IHHNV、蝦白點病WSSV、蝦桃拉病毒TSV、草蝦桿狀病毒 MNV、傳染性肌肉壞死病毒 IMMV、蝦血細胞虹彩病毒 (十足目虹彩病毒)SHIV)。